在全球环保意识日渐高涨的情况下，无论是汽油或柴油引擎，如何降低对环境的损害，都成为各大车厂所重视的课题；身为梅赛德斯-奔驰旗下的中坚车款，E-Class除了拥有堪称全球最干净的BLUETEC柴油引擎，搭载于CLS-Class上的第二代汽油直喷引擎，也已加入E-Class的动力阵容之中。
BLUETEC：世界上最清洁的引擎
E320 BLUETEC柴油车于2006年在拉斯维加斯发布，并在美国市场推出，以较同级汽油车款更具竞争力的油耗性能，开拓了梅赛德斯-奔驰在美国豪华柴油车新领域的实力。
E320 BLUETEC强劲的3.0升V6柴油引擎，可输出高达208匹马力，比拟V8引擎的充沛扭力，同时又能兼4缸引擎般的低油耗；根据原厂公布的综合油耗资料，E320 BLUETEC每百公里仅需6.7升柴油，续航力更达到1,200公里的水平。同时，BLUETEC柴油科技在环保方面的表现，按照测试数据，不仅符合欧洲第五期排放标准，亦能通过美国50州的环保认证，从而在排放标准上大幅领先现行柴油车款。
而在2007年法兰克福车展亮相的E300 BLUETEC，已投放于对柴油车款有强烈需求的欧洲市场。新一代的BLUETEC柴油引擎，保留了原先CDI柴油引擎的特长，可输出211匹最大马力与55.0牛.米的最大扭力，并拥有244km/h的最高极速与0-100km/h加速仅7.2秒的成绩，而平均油耗为13.7km/l的水平，在性能与经济性上有上佳表现。
来自J.D. Power的一份研究报告表明，节节攀高的油价让柴油车市场被逐渐看好，预计在2015年，柴油车将可由现行的18%全球占有率，攀升到30%的全球占有率。因此，在看好柴油车市场的前景后，E320 BLUETEC只是导入新一代豪华柴油车的开端，在可以预见的未来，梅赛德斯-奔驰将会把新一代柴油引擎的推广，列为重要的全球发展目标。
CGI引擎：汽油缸内直喷技术的先锋
在汽油引擎方面，梅赛德斯-奔驰也推出了E 350 CGI作为对环保议题的响应。搭载全球首颗运用压电技术(piezoelectric)的堪称新一代汽油缸内直喷革命的CGI引擎(CGI, Stratified-Charged Gasoline Injection)，突破了现行燃油喷射技术在引擎转速上的限制，在时速超过120公里时，仍可进行精密控制油气混合比，让燃油效率更为优异。
在2006年春天，E 350 CGI引擎便出现在CLS 350 CGI车款的车身上，和普通E 350相比，不仅最大马力增加了20匹达到292匹的水平，而0-100km/h加速仅6.8秒，平均油耗数据更降低10%，仅为11.5km/l。
蓝色环保科技：迈向“零排污”
梅赛德斯-奔驰一直将“永久发展”列为汽车科技研发的重要议题，并在2008年7月成立了“永续发展委员会(Sustainability Board)”，由戴姆勒公司最高管理阶层来负责主导。梅赛德斯-奔驰表示，基于企业永续经营的目标，研发部门平均每日投资约1,100万欧元的经费用于车辆研究与开发，希望在完美展现汽车工艺魅力的同时，也能肩负起环境保护的企业社会责任。