１１月３日进行的第十三届世界湖泊大会上，一些专家提出，目前非点源污染已逐渐替代点源成为世界上湖泊水质问题的主导因素。
据介绍，点源污染是我国大多数湖泊流域的主要污染源，具有排放位置固定、排放量相对稳定等特点，对其进行系统化的调控必不可少。非点源污染主要来自于城镇径流、农田化肥使用、土壤侵蚀、畜禽养殖等方面。随着降雨和农业灌溉，这些污染物流入湖泊造成污染。
中国科学院院士、中国水利水电科学研究院水资源所所长王浩认为，长期以来，来自工业以及城镇污水处理厂废水排放的点源污染被当作入湖的主要污染源,我国湖泊管理主要针对这些点源污染进行。而随着人们对湖泊及其流域环境问题认识不断增强，非点源污染已逐渐替代点源成为世界上湖泊水质问题的主导因素，但在我国对其控制仍属起步阶段。
中国科学院南京地理与湖泊研究所研究员秦伯强也说，非点源污染是造成湖泊污染的重要因素。因受到土壤、气候和地形等因素的影响，非点源污染具有随机性、广泛性、滞后性等特点，因此很难控制，其入湖污染物削减问题是世界及我国面临的重要挑战。
为解决此问题，不少专家建议相关部门采取更系统化的方法，将湖泊流域作为整体治理湖泊，同时提高公众环保意识，从源头上修复湖泊生态。