重庆市环保局从10个方面部署2010年水污染防治工作。
一是全面完成规划项目实施。进一步加快推进《规划（修订本）》项目实施，确保《规划（修订本）》245个需要实施的项目全面完成建设任务。二是强力推进次级河流综合整治。纳入《规划（修订本）》的8条试点的次级河流综合整治主要工程项目全面完成，主城区污染严重的9条次级河流实现开工建设。三是保障城乡饮用水源安全。结合乡镇饮用水源的调查结果，进一步加强城乡特别是乡镇饮用水源的保护工作。四是全面开展沿江排污口整治工作。完成库区142个直排长江的排污口截流整治工作。五是编制实施《三峡后续工作规划》中水污染防治专项规划的实施方案。六是完成库区水污染防治“十二五”规划编制工作，实现与《三峡工程后续工作规划》中水环境项目的无缝衔接。七是加快推进消落区生态环境综合整治。开展库区生态移民，实施生态屏障工程，争取国家在三峡库区开展生态补偿试点。 八是继续加大漂浮物清理工作。按照“江面清、库岸洁”的要求，建立经常性与突击性相结合的工作机制，加强江面漂浮物清理，确保库区水域清洁。九是强化农业面源污染防治。继续推进限养区、适养区畜禽养殖污染整治，完成所有禁养区经营性畜禽养殖取缔关闭，完成15万口沼气池建设任务，巩固库区水域投饵性网箱（栏）养殖取缔工作。十是加强库区环境安全防范工作。继续开展整治违法排污企业保障群众健康环保专项行动，加强重点污染源的监管，做好重点企业环境安全隐患排查工作，加强三峡工程175米蓄水期间的环境监测与应急防范，确保库区水环境安全。