一般作业环境中化学性有害因子入侵的途径，大致上可经由吸入、皮肤接触与食入等；而物理性有害因子的入侵途径，大多利用不同能量的释放或能量提供不足，使器官直接间接受伤害。
1.由呼吸系统进入
一般成年人的肺脏组织和气体有很大的接触面，按全肺的接触面约为90平方公尺，肺泡的接触面约为70平方公尺。如此大的接触面，再加以毛细血管网140平方公尺的表面积，及其内不断地循环中的血流，使肺可以很快的将进入肺泡空气中的污染物融入血红素中。因此，所有气态、液态和固态的空气污染物均可以快速地经由呼吸作用进入肺部，直接对呼吸器官造成伤害；或经由血液循环，对人体造成全身性的伤害。
2.由皮肤接触渗入
部分有害因子与皮肤接触后，会引起下列不同的反应：
(1)皮肤上层的脂肪层可以有效的防止有害物质的穿透、伤害或发生其它器官功能的障碍。
(2)与皮肤表面起反应，会造成局部性刺激使得皮肤发炎。
(3)有害因子可穿透皮肤并与组织蛋白起生化反应，结合而引起皮肤过敏。
(4)有害因子穿透皮肤进入血液，随血液循环而造成系统性中毒。
虽然皮肤重要的生理功能之一为充当防护障壁，以免异物进入，但严重甚至致死性的中毒，曾发生于只有部分皮肤暴露于高毒性物质中，诸如巴拉松、有机磷剂、烷基铅等。擦伤、裂伤与切伤等可大大地增加皮肤的穿透性。
3.由消化系统进入
部分有害因子经由口腔进入后溶于唾液中，通过胃、小肠与食物养分同时被吸收；部分亦可经由肠道直接排出体外。一般而言，毒物经由食入途径造成人体健康的危害远较吸入、皮肤接触途径轻微。其原因有下列三项：
(1)能被食入的有害物不多，因为蒸气和气体根本是无法经由食入进入人体的。
(2)接触的次数和程度很有限，时间短、数量也较轻微。
(3)食入的毒性通常要比吸入的为轻，原因是食入的毒性不易吸收入血液，且受到体内胃液（酸性）与胰液（碱性）的作用，会把毒性物质经由水解而成为低毒物质。
另外，大多数的物理性危害因子对于人体的危害是直接接触伤害之部位，其危害的方式多利用危害因子所释放的能量，而导致器官短期或长期的伤害。
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