加氢装置停工首先反应系统降温、降量。在此过程中应遵循先降温后降量的原则。反应系统进料量降低，空速减小，加氢反应器温升增加，易出现反应“飞温”现象。所谓“飞温”就是反应器温度迅速上升，以致不可控制的现象。
(2)用低疑点原料置换整个系统
加氢装置的原料油一般较重，凝点较高，在停工时易凝结在催化剂、管线及设备当中。为避免上述情况出现，在停工前应用低疑点油置换系统，所用的低疑点油一般为常二线油。
(3)停反应原料泵
切断反应进料时，应注意反应器温度应适宜，使裂化反应器无明显温升。
(4)反应系统循环带油及热氢气提
切断反应进料后，反应加热炉升温，用热循环氢带出催化剂中的存油，热氢气提的温度应根据催化剂的要求确定，一般为400℃左右，热氢气提的温度不能过高，以避免催化剂被热氢还原。
(5)反应系统降温、降压
加氢反应系统按要求的速度降温、降压。
(6)反应系统N2置换
反应系统用N2置换成N2环境，使系统的氢烃浓度<1％。
(7)卸催化剂
使用过的含碳催化剂在空气中易发生自燃，反应器是在N2气环境下进行卸催化剂作业，必须由专业的卸剂公司人员进反应器进行卸剂，因此，在卸催化剂装桶应使用N2或干冰保护催化剂，避免催化剂自燃。
(8)加氢设备的清洗及防腐
加氢装置高压部分的设备及部件，在停工后应用碱液进行清洗，以避免在接触空气后发生腐蚀，损坏设备。另外，高硫系统的设备主要是后处理部分在打开前应用水进行冲洗，以避免硫化铁在空气中自燃。
(9)装置退油及吹扫
加氢装置停工，应将装置内的存油退出并吹扫干净，保证不留死角。
(10)辅助系统的处理
加氢装置停工后将装置的火炬系统、地下污水系统等辅助系统处理干净，并加盲板使装置与系统防腐以使装置达到检修条件。