建立安全生产保证体系是项目经理部的基本任务。建立和实施体系是一个规范的有计划的系统性工作过程，一般程序可分为以下三个阶段。
一、前期与策划阶段
（一）教育培训，统一认识
安全生产保证体系的建立和完善的过程，是始于教育，终于教育的过程，也是提高认识和统一认识的过程。教育培训要分层次、循序渐进地进行。
1 管理层
全面接受施工现场安全生产保证体系规范有关内容的培训，方法上可以采取讲解与研讨结合，理论与实际结合
2 操作层
本岗位安全活动有关内容，包括在施工作业中应承担的安全和环保任务和权限，以及造成安全和环保过失应承担的责任等。
（二）组织落实，拟定计划
1 领导小组
由项目经理部负责人任组长，负责安全生产保证体系建立过程中重大问题的决策和组织协调，如体系建设的总体规划，制定安全目标，提供人、财、物的支持等。
2 工作小组
由项目经理部主要部门（岗位）人员组成，应具有开展相关工作的知识和技能。在领导小组指导下，开展安全生产保证体系建立过程中涉及施工现场范围内的具体工作，如组织宣传教育，体系策划、体系文件的编制汇总等。
二、文件化阶段
按照相关的法律法规、标准规范和其他要求编制安全生产保证体系文件。
（一）体系文件编制的范围
1 制定安全目标；
2 准备本企业制定的各类安全和环境管理标准，贯彻ISO9000族标准、ISO14000系列标准或GB/T28000系列标准的项目，可以在作出必要实施说明后，直接执行部分适用的质量、环境或职业健康安全体系程序文件，如采购、分包、培训、过程控制、检查考核、内审程序文件及其支持性文件等；
3 准备国家、行业、地方的各类有关安全的法律法规和标准规范；
4 编制项目经理部安全生产保证计划及相应的专项计划、专门方案、作业指导书等支持性文件；
5 准备各类安全记录、报表和台账。
（二）体系文件编制的过程
1 由工作小组结合工程项目的实际和特点，在施工准备阶段对需要建立的安全生产保证体系搜集信息并提供依据，主要内容包括：
（1）识别与确定本项目适用的法律法规，标准规范和其他要求；
（2）识别、评价和确定本项目施工现场各类活动、产品、设施设备、场所所涉及的危险源和不利环境因素，特别是重大危险源和重大不利环境因素；
（3）审查与施工现场有关的安全和环境管理的运行程序、规章制度和作业指导书，评价其有效性。
这些工作做得好，才能在建立和实施安全生产保证体系的过程中抓住重点和关键，有的放矢，使安全生产保证体系能全面有效地运行。
2 根据上述调查分析结果，对本项目的安全生产保证体系进行总体设计，主要包括：
（1）制定安全目标和指标。根据我国“安全第一、预防为主”的安全方针，针对已识别的重大危险源和重大不利环境因素，制定具体的安全目标，可能时还需分解为可测量或量化的指标。
（2）确定组织机构和职能分配。对本项目管理职能进行分析，按合理分工、加强协作和赋予权限的原则，设置项目经理部部门（岗位），确定组织结构关系，并把施工现场安全生产保证体系规范中#& 个要素所涉及的职能逐一分配到部门（岗位）。
（3）确定对本项目已识别的危险源和不利环境因素的控制方法。
（4）编制管理方案。针对已识别和评价出的重大危险源和不利环境因素，以及相应的目标和指标要求及技术措施，编制相应的专项管理方案或安全措施计划。
（5）编制施工现场安全生产保证计划。对本项目如何具体贯彻施工现场安全生产保证体系规范的各个要素的要求作出相应描述。
（三）体系文件编制的要求
1 安全目标应与企业的安全总目标、已识别的重大危险源和重大环境因素协调一致；
2 安全生产保证计划应围绕安全目标，将要素用矩阵图的形式，按职能部门（岗位）进行安全职能各项活动的展开和分解，依据安全生产策划的要求和结果，对各要素在本现场的实施提出具体方案。关键是讲究实效，不走形式，既要从总体上和原则上满足规范和有关要求，又要在方法上和具体做法上符合本单位、本项目的实际，突出本项目的重点和关键环节，在能够实现控制的前提下，做到简炼、明确、易懂、可操作。宜单独编制，对工艺简单的小型工程也可在项目施工组织设计中完整地体现。
3 体系文件应经过自上而下，自下而上的多次反复讨论与协调，以提高编制工作的质量，并对安全生产责任制、安全生产保证计划的完整性和可行性、项目经理部满足安全生产和环境保护的保证能力等进行确认，建立并保存确认记录；
4 体系文件需要在体系运行过程中定期、不定期地评审和修改，以确保其完善和持续有效。
三、运行阶段
1 发布施工现场安全生产体系文件，有针对性地多层次开展宣传教育活动，使现场每个员工都能明确本部门（岗位）在实施中应做些什么工作，使用什么文件，如何依据文件要求开展这些工作，以及如何建立相应的安全记录等。
2 配备必要的资源和人员。首先应保证适应工作需要的人力资源，适宜而充分的设施、设备，以及综合考虑成本、效益和风险的财务预算。
3 加强信息管理、日常安全监控和组织协调。通过全面、准确、及时地掌握安全管理信息，对安全和环保活动过程及结果进行连续的监视、测量和验证，以及对涉及体系的问题与矛盾讲行协调，促进安全生产保证体系的正常运行和不断完善，是形成体系良性循环运行机制的必要条件。
4 经过一段时间的试运行，由项目经理部和企业按规定对施工现场安全生产保证体系运行进行内部审核，验证和确认安全生产保证体系的符合性、有效性和适宜性，重点是体系文件的完整性、符合性与一致性，以及体系功能的适用性和有效性。通过内审暴露问题，组织制定并实施纠正措施，达到不断改进的目的。
5 在内审的基础上，项目经理部应收集来自外部与内部各方面的信息，对运行阶段的进行安全评估，即对体系整体状态作出全面的评判，对体系的适宜性、和有效性作出评价。根据安全评估的结论，决定对体系是否需调整、修改，适当时可作出是否提出上级机构内审或认证申请。