制定目标指标和环境管理方案是环境管理的一项重要工作，系统和科学地制定合理的目标指标和环境管理方案是环境管理体系运行的关键，它能够直接影响体系运行的效果（环境绩效）和管理战略的贯彻效果。目标指标的制定并不是一件孤立的工作，是一项系统管理项目，必须充分适宜合理地考虑企业的具体的环境状况、整体经营管理情况和所处的社会环境，才可能确定适合企业生产经营和环境管理的目标指标。
在环境管理体系建立时只有做好全面系统的初始环境评审工作，才能充分了解企业本身的活动、产品、服务中对和可能对环境有影响或较重大影响的那些环境因素或重要环境因素及其环境影响的程度，充分了解应遵守的与环境管理（环境因素的管理）相关的法律法规和其它要求，充分了解企业的环境及其管理现状，充分了解企业当前的经济和技术能力（解决环境问题的保证），充分了解目前可以挖掘的潜力，为确定今后环境管理的工作的内容和方向打下坚实的基础，也为科学制定目标指标和环境管理方案做好了充分的准备。
在环境管理体系运行过程中，也要通过定期或不定期的管理评审，分析和总结过去的工作及问题，确定以后的工作内容，制定新的目标指标和环境管理方案。
1．确定环境管理责任部门和人员
初始环境评审的实施需要确定一个组织部门或责任部门（也可以成立一个工作组），确定环境管理责任部门和相关人员，使其在环境管理体系建立过程中始终起到组织和协调作用，使环境管理的实施更加有效和高效。这个责任部门或工作组中应该具备富有本企业管理经验和管理阅历的人员，具备富有指挥、组织和协调的管理人员，具备富有实干精神的工作人员。能够负起这个职责的部门最合适应该是企业的企管部、企管办、企划办（某些企业的这些部门往往不具备这些职责和功能），其应该负起整体管理因素（如质量因素、成本因素、环境因素和分析因素等）的管理的策划和协调，辅以其他部门（如企业内部环保部门）的配合和全员部门的参与。有的企业由其内部的环保部门从头到尾负责环境管理的实施和操作，往往达不到全面推广的效果，这是因为环境管理属于一种企业管理，与环境保护是有一定区别的（包含了环境保护但内容更广泛），所以在实际工作中单纯依靠企业内部的环保部门往往是不够的，必须要有其他部门的全员参与。
通过初始环境评审可以为以后岗位环境因素管理的内容的确定、进一步为环境管理职责的确定提供依据和奠定基础。
2．全面确定企业相关的法律法规和其他要求
确定企业与环境因素管理相关的所有适用的法律法规和其他要求，不但要确定那些技术性的和污染物排放型的法律法规和其他要求，还要确定那些适用的管理性的法律法规和其他要求。法律法规和其他要求的收集和确定要尽量基于原来企业的收集渠道，尽可能发挥各部门现有的信息交流渠道，发动各部门积极参与，才能尽可能全面充分地收集到与环境因素相关的法律法规、行业标准、规章制度、相关方的其他要求。
通过法律法规和其他要求的收集渠道，其中与企业各岗位环境因素管理适宜的法律法规和其他要求及其相关内容，可以为岗位环境管理职责的确定、环境因素的评价和环境因素管理的规章制度的制定提供重要依据。
3．全面确定和评价环境因素
与适用的法律法规和其他要求的确定的同时，要确定那些企业能够可知和施加影响的活动、产品和服务中的环境因素，并根据相关的法律法规和其他要求以及企业综合能力的情况，评价这些确定出来的环境因素，为环境管理战略战术的确定提供依据。环境因素的识别、确定和评价工作，要尽可能地发动相关的各部门和各级人员出谋划策和积极参与。
企业的各级领导最明白企业的整体管理战略方针和政策，而各级员工尤其是生产经营第一线的员工，才最了解大多数环境因素、相关的环境影响、过去对这些环境因素管理的方法和效果。所以只有使各级员工充分明确和了解环境管理的意义、内容和基础知识，使其积极参与环境因素的识别和确定，才能理论联系实际，一切从实际出发（才能一切为实际服务），才能尽可能全面充分地识别和确定企业活动、产品和服务中可以控制和施加影响的环境因素。对于初步确定出的环境因素，最好再经过相关的员工的确认，其结果就可能比较正确和准确。正确和准确地确定了环境管理对象，就为环境管理的实施开了一个好头。环境因素确定工作进行的越充分和正确，以后的环境管理工作就越方便和有效。
4．确定企业的整体环境管理战略战术
明确了企业应该遵守的法律法规和其他要求，明确了环境管理的义务和方向确定了环境管理的方向；评价了企业的环境因素，明确了环境管理的重点；了解了企业生产经营和整体管理的战略规划和要求，了解了企业环境管理的现状、差距和潜力；就可以有针对性地确定企业的整体环境管理战略战术。企业环境管理战略战术的制定一定要以生产经营和岗位工作的内容为根本、以企业的行之有效的管理原则和方法为基础、以改进和简化原来不适宜的管理为目的、以明确职责减少内耗为目标，才能制定切实可行、行之有效和持续以衡的环境管理原则和管理方法。否则只能是浮于表面和形式化，起不到多少作用并且寿命不长，有时在获取环境管理认证证书后“突然死亡”（也许本来就没有活过）。
5．全面了解企业的各项资源和综合能力
全面了解企业的各项资源和综合能力的目的，就是要为以后的尽力而为和量力而行的制定适宜、有效和高效的环境管理战略战术和规章制度提供科学合理的依据。这就是PDCA管理中策划Plan的第一步也是最重要的内容之一，也就是具体问题具体分析的具体体现。通常需要了解的企业的各项资源和综合能力包括以下几个部分：
（1）企业的人力资源
企业的人力资源包括各级人员的平均道德水准、知识水平、知识构成、理论和实践经验、人际交往、接受能力、适应和应变能力，包括领导层的管理知识、管理水平、管理经验和考核情况，包括操作层的技术水平、操作经验和考核情况等。
企业生产经营最主要和最重要的资本就是企业的企业文化，而企业文化的核心内容就是人力资源。所以全面了解企业的人力资源，合理、有效和高效地调整和配备人力资源是企业管理的主要和首要课题。
（2）企业的物力资源
企业的物力资源通常包括企业的固定资产，包括企业的生产经营设备、生产经营工艺技术和手段、企业的知识产权和专利技术、各项后勤保障设施和措施、各项服务设施和手段等。企业的物力资源是企业生产经营的基础。
（3）企业的财力资源
从管理的角度需要了解的企业的财力资源包括企业的流动资金、融资能力、资金周转能力、资金调动情况、资金使用情况和生产经营收益情况等。企业财力资源的综合情况反映了企业生产经营情况，也从一个侧面反映了企业的整体管理情况。财力资源的情况可以为管理的持续改进提供强有力的依据。
（4）企业的信息资源
信息是现代化生产经营的根本之一（在第九章中详细描述），所以企业的信息资源保障对于企业在市场竞争中的生存和发展至关重要。信息资源通常包括信息收集或获取的渠道、信息筛选和分析的方法和能力、信息的储存和传递方法和能力、信息的利用能力和效果、信息的（内部和外部）交流和处置渠道和能力等。同样，信息资源的情况可以为管理的持续改进提供强有力的依据。
（5）企业的外协能力
现代企业的生产经营是处在市场竞争和合作的氛围之中的，企业的外协能力的强弱对企业的生产经营也有很大影响。企业的外协能力通常包括信息交流的范围和能力、融资的范围和能力、应急的协作范围和能力、与各级政府部门的协调关系、与各供方的合作与协调关系、与各代理商和承包商的合作与协作关系、与客户的交流方式与能力、与其他相关方的交流与协调能力等。只有全面充分地考虑各相关方的利益和关系、充分考虑潜在的合作伙伴、利益伙伴和客户，才能主动地为企业的生存和发展创造充分和必要的条件，才能在市场竞争和发展中获得一席之地。
（6）企业的应急能力
企业的应急能力包括企业的市场需求的应变能力、客户变化的应变能力、竞争的应变能力、融资能力、资金周转能力、库存处理能力、生产计划应变能力、生产计划变更后的生产应变能力、人员变动的应变能力、抗风险和防事故的能力、风险和事故发生时的应变能力（在第十二章中详细描述），这些能力的适宜性和有效性是否合理是衡量企业管理是否现代的主要标准之一。在千变万化和风云突变的市场竞争的条件下，如果企业具有系统的风险管理体系和系统的应变措施和能力，就能以不变应万变，尽可能降低经营风险，既可顺应潮流又能把握机遇。
6．确定环境方针
在全面了解了企业的环境管理对象即环境因素、了解了企业目前环境管理的主要问题（重要环境因素）和现状、了解了与这些环境因素管理相关的法律法规和其他要求、了解了企业的整体管理和综合能力、了解了企业目前环境管理上的缺陷和潜力以后，就可以明确环境管理的方向和战略方针，可以制定环境方针（在第二章中详细描述），确定环境管理目标指标的框架，为以后环境管理规章制度和内容的确定确立框架和打下基础。
7．落实相关的环境管理内容
确定了环境方针，全面充分了解和环境因素和有关管理原则，就需要对环境因素的管理内容进行分析和分解，将环境因素（和重要环境因素）的有关管理内容与有关岗位工作和管理内容相结合，为以后确定环境管理职责做准备，为以后确定建立环境管理体系的组织和内容框架做准备。
8．坚持持续的环境评审管理工作
（1）坚持环境评审的管理方法
由上我们已经明确了环境评审的目的和作用，在以后的环境管理工作中就应该充分发挥这种环境评审的作用，运用这种环境评审的方法和原则，根据环境管理的具体情况，实施环境再评审或再次环境评审，始终做到知己知彼才能运筹帷幄。再次环境评审的内容和结果也是管理评审的一个重要输入，也可以为管理评审提供重要材料。
实际上如果企业的环境管理体系运行正常和有效的话，在环境管理过程中自然而然地会有意或无意地进行环境评审工作。无论称谓如何，只要包括了环境评审的内容都是属于环境评审的范畴，自然而然地在日常工作中实施了管理的内容和原则，就是管理的最高境界（此时“无招”胜似有招），就是最高效的管理。
（2）坚持持续改进的管理目标
管理绩效和管理水平的持续改进是每一个管理人都在有意或无意追求的事情。而环境评审的逐渐熟练和推广到整体管理中去则是将其深化和提高的持续改进的内容，不断总结（可以通过各级和各种监督检查和评审实现）环境评审的经验教训，总结出一套“单项管理”评审的方法，运用于其他项目的管理的评审中（当然环境评审也可以借鉴其他单项管理的评审经验），以此带动和提高整体管理的水平，这样才能够使各项管理和整体管理的发展起到互为帮助、互为协调和互为提高的良性循环的作用。
通过环境评审工作，可以了解环境管理的现状、差距和潜力，为环境管理体系的建立、实施和保持奠定基础。同样，可以采取同样的思路和原则进行质量评审、安全评审、财务评审、风险评审等方法，了解质量管理、安全管理、财务管理、风险管理的现状、差距和潜力，为质量管理体系、安全管理体系、财务管理体系、风险管理体系及其一体化管理体系的建立、实施和保持奠定基础。