组织建立、执行、维持及改善ISO 14001环境管理系统的目的，除为取得第三者（如验证机构）认可登录，藉以向各利害关系团体展示其符合ISO 14001标准要求外，其最大效益在于组织整体环境成效的持续改善、直接或间接降低营运风险及提升组织持续发展的竞争力。因此，取得ISO 14001认证，只是建立环境管理系统的消极目的，其积极意义应着眼于善用PDCA循环的“持续改善”精神，共同维护、改善工作及生活环境，以达成环境保护与经济发展并进的目标。
组织要获得整体环境管理的成效，并达到持续改善的目的，除依据ISO 14001要求，不断地规划、执行、审核、矫正与执行外，还要定期通过“环境管理系统之审核（如内部审核、外部审核）”执行系统的诊断，以客观、公正、专业的手段，了解组织环境管理系统运作的情况，提供各部门、各阶层人员持续改善的参考，并作为管理阶层执行管理审查的依据。惟有不断且合理地审核，才能认知和改善组织环境管理系统的落差及盲点。
依据中华人民共和国品质管理及环境管理认证委员会所订的“环境管理验证机构认证规范”的要求（国际间其它认证机构也有同样要求），认证机构应定期执行后续审核，以查证已通过验证／登记的组织是否能继续符合验证／登记的要求。
有关ISO 14001后续审核的目的及重点，经参考ISO 14001、14004、14010、14011及14012等相关文件的要求及指导原则，有如下概述：
一、后续审核的目的：
●查证组织环境管理系统是否仍切实地实施与维持。
●发掘组织环境管理系统中，可改善的不合理事项及缺点。
●确认组织环境管理系统是否仍符合ISO 14001的要求（含既定承诺、程序、工作规范等）。
●查证组织整体环境管理的成效（如污染预防、持续改善、法规符合性的改善等）。
●查证组织环境管理系统与各利害相关机构（如员工、附近居民、主管机关、客户、消费者、分包商等）的互动关系。
●确认组织是否提供充份信息给最高管理阶层，执行管理审查，以利于整体环境的改善。
●通过公正、客观与专业的后续审核，提出组织环境管理系统的盲点及差距。
●查证组织是否仍符合验证／登记之要求。
二、后续审核的重点：
☆对上一次审核缺点的改善情况。
☆法规的符合性。
☆检查组织机构执行环境管理系统的情况：
☆是否包括对环境管理系统有“明显和直接责任”的相关部门。
☆审核方案与程序的切实性。
☆审核的有效性。
☆是否将审核的结果信息提供管理阶层及受审核者。
☆管理审查执行状况及内容。
☆各利害相关团体意见的处理。
☆环境成效的实质状况。
☆目标、标准及管理方案的追踪。
☆异常或意外事件的处理与预防措施。
☆组织所属人员对环境及环境管理系统的认知度与认同感。
☆作业管制的落实性。
☆监视与量测的确切性。
☆环境重点议题的沟通状况。
以上只摘述后续审核的重要意义，不同环境虽具有不同的环境参考面与环境冲击面，但审核的目的与重点，无非是：了解环境，改善环境，认同环境，经营环境。