多年前他就被人称为：
“有国际声望的中国青年科学家”
绍兴，江南鱼米之乡，一座古老的历史文化名城，大禹、勾践、陆游、王羲之、秋瑾、蔡元培、鲁迅、周恩来等人的名字同这座古城联系在一起。冯长根出生在绍兴一个普通工人家庭。1965年小学毕业后，读了一年初中，赶上“文革”，1969年到绍兴义道房(时称胜利人民公社胜利大队)插队落户。４年后，进浙江先锋机械厂当了一名学徒工。
1975年，他进入北京理工大学成了一名大学生（时称工农兵学员）。3年后，恢复高考的第二年，他以优秀成绩考上了“文革”后的第一届研究生。可以说，这段时间是冯长根一生的转折期。
研究生上了一年，1979年10月，冯长根赴英国留学，先在兰卡斯特大学学习语言，后进入利兹大学化学院物理化学系。在英期间，他在《英国皇家学会会刊》、《英国皇家化学会会刊》等国际著名刊物上发表学术论文14篇。1983年，冯长根完成博士论文。他在论文的最前面用中英文工整地写上:“本论文献给我的祖国——中华人民共和国”。年底，冯长根回到了母校——北京理工大学。这一年，他整30岁。
冯长根完成的第一部专著是《热爆炸理论》（1988年），这本书荣获第5届全国优秀科技图书一等奖。他的第二部专著《热点火理论》（1990年），荣获第六届中国图书奖二等奖。他的其他著作还有《抽样检验》、《小尺寸微通道爆轰学》、英文专著《Thermal Theory of Explosion and Ignition》。
回到祖国后，冯长根在事业上大踏步前进。他的专业得到世界银行125万美元贷款，建立了“爆炸灾害预防与控制”国家级重点实验室，他担任了实验室最早的主任。他先后到美国、加拿大、日本、德国、法国、英国、芬兰、瑞典、挪威、丹麦、葡萄牙、韩国、马来西亚参加国际会议和学术访问，并作为高级访问学者在英国利兹大学和剑桥大学进行了为期半年的学术研究。
1989年，他被破格晋升为教授，1990年起成为博士生导师，是当时国内最年轻的博士生导师之一。从1990年培养第一位博士生起，至今已有42名博士生和21名硕士生毕业，6名博士后出站。其中有的人也成了博士生导师、教授(研究员)、副教授(副研究员、高工)。
冯长根教授及其学科组已在国内外发表学术论文300余篇，研究成果和著述得到国内外同行专家教授的称赞，多年前就被人称为“有国际声望的中国青年科学家”。1999年至2001年冯长根教授任北京理工大学副校长。他曾任中国科协第五届副主席、北京市科协第五届副主席。2001年6月担任中国科协书记处书记、党组成员。
“问渠那得清如许，为有源头活水来”。1989年10月1日晚，中央电视台记者在天安门广场现场转播的采访中，请冯长根教授谈谈尊重知识、尊重人才的体会，他谈了三点感受： “首先，我所取得的成绩，是党和人民的培养以及领导和教师们辛勤培育的结果。所以，我觉得为国家做出自己的贡献是义不容辞的。其次，在我的成长中，我遇到了很多好机会，很幸运，这些都是因为有了党的十一届三中全会的正确路线，有了改革开放。我能够出国，能够成为一名教授，这许许多多机会是和改革开放分不开的。最后，我只做了很少一点点工作，党和人民却给了我很多荣誉。青年人的工作和成绩能够被社会承认，我心里特别高兴。希望今后有更多的青年人的工作得到社会的承认，能有更多的青年获得脱颖而出的机会。”这三点感受是冯长根教授内心的真实写照，显示了他作为一名科技工作者献身科学、为振兴祖国科技事业不断奋斗的美好愿望。