职业健康安全管理体系审核是一项专业要求较高的审核，也是一项对受审核组织能够起到很大的推动和促进作用的工作。审核质量的好坏也直接影响到受审核方对认证的看法。而一阶段审核又是做好认证审核的基础和保证。因此审核中必须注意以下几个方面：
一、危险源识别的审核应充分
首先，应了解受审核方业务活动的划分，了解其日常管理和生产过程的每一个环节。业务活动的划分可分为生产主线和辅助活动。生产主线应明确生产工艺、每个生产工序中使用的设备、操作人员要求、使用的原材料。辅助活动应明确受审核方管辖范围内的场所，如仓库、锅炉房、维修车间、化学品库等。审核方根据上述内容为有效地识别危险源创造条件。
其次，确定每项活动和每个场所中可能存在的事故风险，可以通过了解安全操作要求、曾经发生过的事故、法律法规要求等确定存在的风险。
最后，确定风险或事故发生的根源。与受审核方充分沟通，了解在什么情况下、由何种原因可能导致事故的发生，事故或风险存在的根源就是危险源。通过风险分析，确定控制重点，即重大风险的危险源。
审核员在审核过程中应能够根据自己所掌握的专业知识，有效地判断每个场所和每道生产工序中可能发生的事故及其原因，只有这样才能充分识别出受审核方在进行危险源识别中存在的问题。
二、注意法律法规识别的充分性和适用性
目前，有不少组织在咨询老师的帮助下，识别了大量的法律法规，收集的法律法规很多，但是往往有一部分是不适用的。GB/T28001标准实施指南中明确指出“不要求组织建立法律法规库，而是应收集与本组织的产品、活动和服务中风险相适应的法律法规”。因此，审核中应重点把握与受审核方重大风险有关的法律法规、标准等，注意不能忽略了行业的各种安全操作规程和管理制度，如煤炭行业就有专门的“三大规程”，即安全规程、作业规程和操作规程。因此，要求专业审核员要熟悉行业特点和相关规章制度，具备相应的专业能力。
三、注意目标和方案的制定的可行性
针对确定的重大风险危险源可采用不同的方式实施控制，既可以制定目标和管理方案，也可以通过运行控制和应急方案实施控制。针对管理现状不理想，需要进一步采取措施实施改进的危险源应考虑制定目标和管理方案。而针对控制良好的重要危险源可以不制定管理方案，比如消防管理，如果消防器材配置齐全、员工的消防意识强，而且能够有效地实施应急措施，则可以不另行制定管理方案。制定目标和管理方案时应充分考虑财务状况、技术手段等因素，制定切实可行的目标和管理方案。因此审核过程中不能一概要求受审核方制定目标和管理方案。
四、关注运行控制程序的适宜性和充分性
针对不需要制定管理方案的危险源，可以制定运行控制文件，针对可能出现的紧急情况应制定应急预案。运行控制文件的制定应考虑法律法规的要求，比如危险化学品管理，《危险化学品安全管理条例》规定应制定危险化学品特别是易致毒化学品的管理制度，明确化学品的运输、储存、出入库的管理要求，因此应遵守法律法规的要求。应急预案中应明确发生紧急情况时相关人员的分工、设施设备的要求、应急处理的方法、发生事故后的调查要求等。一阶段审核中应关注运行控制文件和应急预案的可行性和充分性。
五、对生产现场巡视要认真全面
生产现场巡视既是了解受审核组织的基本情况，也是确定危险源识别是否充分的一项重要信息来源。因此，现场巡视中应对受审核方的所有生产现场进行全面的巡视，特别是重要危险源的关键现场，如化学品库、锅炉房、特种设备使用场所、生产车间等，充分了解受审核方危险源控制的状况，及时指出存在的问题，便于受审核方进行改进。
另外，现在有不少审核机构将一阶段审核和二阶段审核合并进行或中间时间间隔很短。这种安排方式应充分考虑受审核方的特点和风险的大小。对于二级以上风险的组织，在一、二阶段审核之间至少应安排一周以上的时间，便于受审核方整改发现的问题，也使二阶段审核更加充分有效。否则一阶段审核就变成了走过场。