氟化反应是一个放热过程，一般都在较高温度下进行氟化，反应剧烈，速度快，热量变化较大。所用的原料大多具有燃爆危险性、毒性或腐蚀性，一旦泄漏危险性较大。例如：常用氟化剂氟化氢气体遇水后产生剧毒、强腐蚀的氢氟酸。
1固有危险性
固有危险性是指氟化反应中的原料、产品、中间产品等本身具有的危险有害特性。
1.1 火灾危险性
氟化反应涉及的原料、产品、中间产品等部分具有易燃性，如制取R134a使用的三氯乙烯，制取五氟化磷使用的黄磷等都具有易燃的特性。
1.2 爆炸危险性
氟化反应涉及的原料、产品、中间产品等部分具有燃爆性，如三氯乙烯遇明火高热能引起燃烧爆炸，黄磷受摩擦、撞击或与氧化剂接触能立即燃烧甚至爆炸。氟化使用的浓硫酸具有强氧化性，与有机物接触能剧烈反应，与普通金属反应放出氢气，极易发生爆炸。
1.3 中毒危险性
氟化反应涉及到的原料、产品、中间产品等大多具有毒性，氟化氢等为剧毒物品。黄磷等为高毒物。这些物质在储存、运输及使用过程中若处理不当都有可能引发恶性中毒事件。
1.4 腐蚀及其他危险性
氟化反应涉及到的氟化氢、浓硫酸等均为强腐蚀性物质，部分氟化反应产生粉尘，能对人体造成伤害，如使用浓硫酸与萤石制备氟化氢过程中，生成的硫酸钙。
2工艺过程的危险性
氟化反应是一个放热过程，所用原料又多为易燃易爆、有毒、强腐蚀物质，因此在氟化反应和原料的储存过程中存在诸多不安全因素，下面分别进行分析。
2.1 反应过程的危险性
氟化反应是一个放热过程，尤其在较高温度下进行氟化，反应更为剧烈。如果放出的热量不能及时移出，就会造成反应温度的进一步升高，而氟化所用的原料多为有机易燃物和强氧化剂，容易造成泄漏，导致有毒物质扩散，并且在这样高的温度下，如果物料泄漏还会造成着火或引起爆炸。
另外，控制原料的投料量和氟化剂的投料速度、正确计量各种原料的投料比及投料顺序均有利于反应过程的平稳运行。
2.2 原料储存过程的危险性
氟化反应中氟化剂有气态氟化氢、固体黄磷和各种浓度的酸。这些物质大多具有毒性、强腐蚀性或易燃易爆性，一旦泄漏或爆炸，将会造成重大安全和环境事故。
对于氟化过程的危险性分析，在具体应用中可按照HAZOP（危险和可操作性分析）分析方法进行。